分公司和总公司不在一个地区，增值税怎么交？

固定业户需向其机构所在地的主管税务机关进行纳税申报。

若总机构和分支机构不在同一县（市），则应分别向各自所在地的主管税务机关申报纳税；经财政部、国家税务总局或其授权的财政和税务机关批准，可以由总机构汇总向总机构所在地的主管税务机关申报纳税。

依据：根据财政部 国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知(财税〔2016〕36号)。